Objective: Surveillance programs and research for acute respiratory infections in remote Aboriginal communities are complicated by difficulties in the storage and transport of frozen samples to urban laboratories for testing. This study assessed the sensitivity of a simple method for transporting respiratory samples from a remote setting for viral PCR compared with frozen specimens.
Methods: We sampled every individual who presented to a remote Aboriginal community clinic in a non-epidemic respiratory season. Two anterior nasal swabs were collected from each participant. The left nare specimen was mailed to the laboratory via routine postal services. The right nare specimen was transported frozen. Testing for 16 viruses was undertaken using real-time multiplex PCR.
Results: A total of 140 participants were enrolled who contributed 150 study visits. Respiratory illnesses accounted for 10% of the reasons for presentation. Sixty-one viruses were identified in 50 (33.3%) presentations for 40 (28.6%) individuals; bocavirus and rhinovirus were the most common viruses identified (14.0% and 12.6% of episodes respectively). The sensitivity for any virus detected in mailed specimens was 67.2% (95%CI 55.4, 78.9) compared to 65.6% (95%CI 53.7, 77.5) for frozen specimens.
Conclusion: The mailing of unfrozen nasal specimens from remote communities does not compromise the viability of the specimen for viral studies.
Objectif: Les programmes de surveillance et de recherche pour les infections respiratoires aiguës dans les collectivités aborigènes éloignées sont compliqués par les difficultés pour le stockage et le transport des échantillons congelés vers les laboratoires urbains pour être testés. Cette étude a évalué la sensibilité d’une méthode simple pour le transport des échantillons respiratoires d’un endroit éloigné pour subir une PCR virale par rapport à celle des échantillons congelés.
Méthodes: Des échantillons ont été prélevés chez chaque individu qui s’est présentéà une clinique de la communauté aborigène éloignée au cours d’une saison non épidémique pour les infections respiratoires. Deux écouvillons nasaux antérieurs ont été recueillis par participant. Le spécimen nasal gauche a été posté au laboratoire par l’intermédiaire des services postaux de routine. Le spécimen nasal droit a été transporté congelé. Les échantillons ont été testés pour 15 virus à l’aide de la PCR multiplex en temps réel.
Résultats: 140 participants qui ont contribuéà 150 visites ont été inscrits dans l’étude. Les maladies respiratoires représentaient 10% des raisons de visite. 61 virus ont été identifiés chez 50 (33,3%) des visites de 40 (28,6%) individus; bocavirus et rhinovirus étaient les plus fréquents (14,0% et 12,6% des épisodes, respectivement). La sensibilité pour la détection de tout virus dans les échantillons postés était de 67,2% (IC 95%: 55,4–78,9), comparéà 65,6% (IC95%: 53,7–77,5) pour les spécimens congelés.
Conclusion: L’envoi de prélèvements nasaux non congelés à partir des collectivités éloignées ne compromet pas la viabilité de l’échantillon pour les études virales.
Objetivo: Los programas de vigilancia e investigación de infecciones respiratorias agudas en comunidades remotas de Aborígenes tienen dificultades con el almacenaje y transporte de muestras congeladas hasta laboratorios urbanos para ser evaluadas. En este estudio se ha evaluado la sensibilidad de un método simple para transportar muestras respiratorias desde un emplazamiento remoto, comparado con muestras congeladas, para realizar PCR virales.
Métodos: Hemos tomado muestras de cada individuo que se presentó en alguna clínica comunitaria Aborigen remota, en una estación no epidémica para infecciones respiratorias. Se recolectaron dos frotis nasales anteriores de cada participante. La muestra de la fosa nasal izquierda se envió por correo al laboratorio mediante el servicio postal rutinario. La muestra de la fosa nasal derecha se transportó congelada. Se realizaron pruebas para 15 virus mediante PCR multiplex a tiempo‐real.
Resultados: Se incluyeron 140 participantes que contribuyeron con 150 visitas dentro del estudio. Las enfermedades respiratorias explicaban un 10% de las razones por las cuales buscaban ayuda. Se identificaron 61 virus en 50 (33.3%) presentaciones para 40 (28.6%) individuos; los más comunes eran bocavirus y rhinovirus (14.0% y 12.6% de los episodios respectivamente). La sensibilidad para cualquier virus detectado en las muestras enviadas por correo era del 67.2% (95%IC 55.4, 78.9) comparado con 65.6% (95%IC 53.7, 77.5) para las muestras congeladas.
Conclusión: El envío por correo de muestras nasales sin congelar desde comunidades remotas no compromete la viabilidad de las muestras para estudios de virus.
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